野生茄子黄萎病病程相关基因StDAHP的克隆与表达分析

doi:Q785 Q786

中国生物工程杂志

2010, Vol. 30

Issue (06): 48-53 DOI: Q785 Q786

研究报告

野生茄子黄萎病病程相关基因StDAHP的克隆与表达分析

王忠^1,2,谢超¹,决登伟¹,黄乐平³,黄全生³,杨清^1*

1.南京农业大学生命科学学院，作物遗传与种质创新国家重点实验室南京 210095
2.江苏省中国科学院植物研究所，植物多样性与系统演化研究中心南京 210014
3.新疆农作物生物技术重点开放实验室乌鲁木齐 830091

Cloning and Expression Analysis of Verticillium wilt Pathogenesis-related Gene StDAHP in Solanum torvum

WANG Zhong^1,2,XIE Chao¹,JUE Deng-wei¹,HUANG Le-ping³,HUANG Quan-sheng³,YANG Qing¹

1.State Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement, College of Life Sciences, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, China
2.Research Center of Systematic and Evolutionary Botany, Institute of Botany, Jiangsu Province and Chinese Academy of Sciences,Nanjing 210014,China
3.Xinjiang Key Laboratory of Crop Biotechnology, Urmuqi 830091, China

全文: PDF(1243 KB) HTML

摘要：

采用RACE和同源序列克隆技术，从野生茄子托鲁巴姆（Solanum torvum）中克隆得到一个DAHP同源基因，命名为StDAHP基因，提交至GenBank，登录号为GU479467。生物信息学分析表明：StDAHP cDNA含有一个 1683 bp的开放阅读框，编码一个由 560 个氨基酸残基组成的蛋白，该蛋白分子量为 62.53 kDa，等电点为9.1。采用DNAMAN 软件对StDAHP和其他同源蛋白的氨基酸序列比对，结果表明：该蛋白与来自马铃薯、番茄、烟草和水稻4种植物的同源蛋白在氨基酸水平有较高的一致性；且在靠近N-末端和C-末端的氨基酸都比较保守。采用半定量 RT-PCR 方法对StDAHP mRNA 水平进行了分析，结果显示：StDAHP属于诱导表达，在病原菌侵染后期维持较高水平。

关键词： Solanum torvum; StDAHP; 克隆; 表达分析

Abstract:

A homologue of DAHP（3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate synthase）, designated StDAHP(GU479467), was isolated from Solanum torvum by homology cloning and RACE. Bioinformatics analysis showed that the full length of the cDNA contained an open reading frame of 1683 bp coding a protein of 560 amino acids, corresponding to a 62.53 kDa polypeptide with an isoelectric point of 9.1. Alignment of the amino acid sequence of StDAHP and that of other homologues showed that StDAHP had a high identity with DAHP from S. tuberosum, S. lycopersicum, N. tabacum, and O. sativa). StDAHP protein was more conservative near its N-terminal and C-terminal. Analysis of StDAHP mRNA level by semi-quantity RTPCR showed that its expression was induced by Verticillium dahliae infection.

Key words: Solanum torvum StDAHP Cloning Expression analysis

收稿日期: 2010-02-22 出版日期: 2010-06-12

通讯作者: 杨清 E-mail: qyang19@njau.edu.cn

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引用本文:

王忠谢超决登伟黄乐平黄全生杨清. 野生茄子黄萎病病程相关基因StDAHP的克隆与表达分析[J]. 中国生物工程杂志, 2010, 30(06): 48-53.

WANG Zhong, XIE Chao, JUE De-Wei, HUANG Le-Beng, HUANG Quan-Sheng, YANG Qing. Cloning and Expression Analysis of Verticillium wilt Pathogenesis-related Gene StDAHP in Solanum torvum. China Biotechnology, 2010, 30(06): 48-53.

链接本文:

https://manu60.magtech.com.cn/biotech/CN/Q785 Q786 或 https://manu60.magtech.com.cn/biotech/CN/Y2010/V30/I06/48

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