寡核苷酸阵列比较基因组杂交技术及其应用

中国生物工程杂志

研究简报

寡核苷酸阵列比较基因组杂交技术及其应用

彭翼飞马文丽

南方医科大学基因工程研究所南方医科大学基因工程研究所

Platforms of Oligonucleotide Array Comparative Genomic Hybridization and Its Application

全文: PDF HTML

摘要： 阵列-比较基因组杂交技术（array comparative genomic hybridization, array CGH）能在全基因组水平和/或高分辨率基础上检测染色体拷贝数的变化，主要应用于遗传学和肿瘤学研究。Array CGH中微阵列探针通常是PCR扩增的BAC克隆或cDNA分子。最近几年，寡核苷酸阵列比较基因组杂交（oligonucleotide array CGH, oaCGH）逐渐开始应用。oaCGH与BAC array CGH比较，具有操作更简便、探针设计更灵活、分辨率更高等多项优点，预计oaCGH将逐步取代利用BAC克隆片段或cDNA分子的array CGH。oaCGH的应用及其与其它高通量检测技术的结合将促进新的癌症相关基因、肿瘤耐药基因的发现。本文综述了现有主要oaCGH平台在空间分辨率、探针长度、灵敏度、特异性等方面的特点及其应用，概括了oaCGH近年来的进展。

关键词： 微阵列; 基因芯片; 拷贝数多态性; 比较基因组杂交; 寡核苷酸

Abstract: The array CGH technique (Array Comparative Genome Hybridization) has been developed to detect chromosomal copy number changes on a genome-wide and/or high-resolution scale. It is used in human genetics and oncology. Generally PCR amplified bacterial artificial chromosomes (BACs) or cDNAs have been spotted as elements on the array. Recently Oligonucleotides as spotted elements on the arrays have been successfully explored. Compared with BAC array CGH, oligonucleotide array CGH(oaCGH) can save considerable time and efforts, be designed with more flexibility and provide much higher resolution with high sensitivity . We expect a gradual transition from BAC array CGH to oligonucleotide array CGH in the coming years. The combination of oaCGH and other high-through put analysis can lead to discovery of a host of novel oncogenes , tumor suppressors as well as tumor drug resistance genes. This review compares the different platforms of oaCGH and its development in recent years.

收稿日期: 2006-05-25 出版日期: 2006-10-25

通讯作者: 马文丽

	服务
	把本文推荐给朋友
	加入引用管理器
	E-mail Alert
	RSS
	作者相关文章
	马文丽
	彭翼飞

引用本文:

彭翼飞,马文丽. 寡核苷酸阵列比较基因组杂交技术及其应用[J]. 中国生物工程杂志, .

. Platforms of Oligonucleotide Array Comparative Genomic Hybridization and Its Application. China Biotechnology, .

链接本文:

https://manu60.magtech.com.cn/biotech/CN/ 或 https://manu60.magtech.com.cn/biotech/CN/Y2006/V26/I10/44

[1]	刘少金,冯雪娇,王俊姝,肖正强,程平生. 我国核酸药物市场分析及对策建议[J]. 中国生物工程杂志, 2021, 41(7): 99-109.
[2]	张雪洁,汤家宝,李廷栋,葛胜祥. 单分子免疫检测技术研究进展^*[J]. 中国生物工程杂志, 2021, 41(4): 47-54.
[3]	陈茹,段燕喻,高小博,刘志玲,阳静,梅明珠,谭鑫,骆海燕. 建立多重液相基因芯片方法快速检测狐狸、水貂成分 ^*[J]. 中国生物工程杂志, 2019, 39(11): 62-69.
[4]	毛开云,陈大明,范月蕾,王跃,江洪波. 全球寡核苷酸类药物开发现状与趋势[J]. 中国生物工程杂志, 2018, 38(4): 96-106.
[5]	张丽丽, 徐碧玉, 刘菊华, 贾彩红, 张建斌, 金志强. *转香蕉MaASR1基因的拟南芥株系在干旱胁迫条件下的表达谱分析*[J]. 中国生物工程杂志, 2017, 37(11): 59-73.
[6]	贾栋, 张彬, 马瑞燕, 唐贵刚, 赵捷, 王文华, 周琳. 免疫共沉淀结合基因芯片对m₃G帽子结构RNA的分离鉴定[J]. 中国生物工程杂志, 2014, 34(2): 65-70.
[7]	姚雪, 刘琪琦, 赵青, 陈苏红. 应用可视化基因芯片技术检测幽门螺杆菌感染个体化药物治疗相关基因[J]. 中国生物工程杂志, 2013, 33(4): 92-100.
[8]	李本杰, 吴小翎, 王璐璐. 比较NRP-1反义寡核苷酸与VEGFR-2反义寡核苷酸对人胃癌SGC7901细胞增殖和凋亡的影响[J]. 中国生物工程杂志, 2012, 32(04): 12-17.
[9]	辛娟, 林福春, 张兵兵, 向燕, 王远亮. 力生长因子E肽对成骨细胞增殖及基因表达的影响[J]. 中国生物工程杂志, 2011, 31(10): 1-6.
[10]	邓汉超, 尹长城, 刘国振, 林健荣, 邓平建. 转基因植物核酸成分检测技术研究进展[J]. 中国生物工程杂志, 2011, 31(01): 86-95.
[11]	高兴王景林. 基因芯片技术在病原细菌检测中的应用[J]. 中国生物工程杂志, 2010, 30(02): 100-104.
[12]	郭斌祁洋尉亚辉. 转基因植物检测技术的研究进展[J]. 中国生物工程杂志, 2010, 30(02): 120-126.
[13]	苏玉金曹倩鲁玲玲孙晓红高华赵莎莎杨慧. Nrf3通路参与星形胶质细胞对抗鱼藤酮毒性的保护作用[J]. 中国生物工程杂志, 2010, 30(01): 19-24.
[14]	尤元海曾浔过玮尹焱张茂俊张建中. 重要肠道病原菌多重PCR-基因芯片检测方法研究[J]. 中国生物工程杂志, 2009, 29(12): 79-84.
[15]	尤元海张建中. 基因表达谱芯片的数据挖掘[J]. 中国生物工程杂志, 2009, 29(10): 87-91.

Viewed

Full text

Abstract

Cited

Shared

Discussed