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中国生物工程杂志

CHINA BIOTECHNOLOGY
中国生物工程杂志  2006, Vol. 26 Issue (0): 101-104    
专稿     
猪4种呼吸道疾病病毒基因芯片诊断方法的建立
高淑霞 吴时友 尹燕博 庄文忠 牛钟相
山东农业大学动物科技学院,山东省农业科学院畜牧兽医研究所 山东澳兰生物工程研究院 山东澳兰生物工程研究院 山东省农业厅 山东农业大学动物科技学院
Low Density DNAarray for Diagnosing 4 Viruses Related to Porcine Respiratory Disease
 全文: PDF(536 KB)   HTML
摘要:

根据Genbank发表的核酸序列,分别设计合成流感病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪圆环病毒2型和猪伪狂犬病病毒的特异引物, 应用PCR(或RT-PCR)分别扩增各病毒的特异片断,并克隆到pMD18-T Simple Vector构建重组质粒,用于各病毒探针的制备。将各探针按一定的阵列点加到硝酸纤维素膜上,制备成低密度基因芯片。在多重PCR过程中,用生物素标记的dUTP(Bio-11-dUTP)对待检样品进行标记,扩增产物与基因芯片杂交,最后用扫描仪进行读片和分析。对临床疑似病例检测结果表明,该方法可以同时检测待检样品中4种病毒的存在情况,与PCR方法相比,显示了较高的灵敏度。该方法的建立,为批量样品的检测和猪呼吸道疾病综合征流行病学调查提供了一种快速、灵敏和高通量的手段。

关键词: 呼吸道疾病综合征基因芯片多重PCR核酸杂交    
Abstract:

Abstract:Based on the published nucleotide sequences of Influenza A virus, Porcine reproductive and respiratory syndrome virus, Porcine cirocovirus-2 and Porcine pseudorabies virus, 4 pairs of primers were designed. And conserved DNA (or cDNA) fragments of the 4 viruses obtained by using PCR (or RT-PCR), were ligated with pMD 18-T Simple Vector to construct recombinant plasmid for DNA probe preparation. The recovered DNA probes were spotted on located sites on nitrocellulose filter to prepare low density DNAarray. During the process of multiplex PCR, samples were labeled by Biotin-11-dUTP. Then the labeled PCR products were hybridized with DNAarrays, and the hybridization signals were scanned and analyzed by scanning device and software. The results showed that this DNAarray could identify and distinguish the 4 viruses in samples synchronously and was more sensitive than PCR method. This method can be use for lab diagnosis, large-scale epidemiology investigation and quarantine of animal and animal products.

Key words: Porcine respiratory disease complex    DNA array    nucleotide hybridization    multiple PCR
收稿日期: 2006-03-13 出版日期: 2006-06-15
通讯作者: 牛钟相   
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吴时友
庄文忠
牛钟相
尹燕博
高淑霞

引用本文:

高淑霞,吴时友,尹燕博,庄文忠,牛钟相. 猪4种呼吸道疾病病毒基因芯片诊断方法的建立[J]. 中国生物工程杂志, 2006, 26(0): 101-104.

. Low Density DNAarray for Diagnosing 4 Viruses Related to Porcine Respiratory Disease. China Biotechnology, 2006, 26(0): 101-104.

链接本文:

https://manu60.magtech.com.cn/biotech/CN/        https://manu60.magtech.com.cn/biotech/CN/Y2006/V26/I0/101

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