siRNA(smallinterferenceRNA)在转录后水平有效地沉默基因表达的现象称为RNAi(RNAinterference,RNA干涉),传统认为它能在转录后水平上有效地沉默基因的表达(posttranscriptionalgenesilence,PTGS)。然而,最近实验研究表明,siRNA是一些甲基化转移酶活化的起始信号,在siRNA的作用下,甲基化转移酶使DNA区域包括胞嘧啶鸟嘌呤核苷酸连续区(称为CG岛),CNG(N:A/T/C/G),CHH(H:A/C/T)中的胞嘧啶核苷C和组蛋白H3亚基第9个赖氨酸K(lysineresidueK9inhistoneH3,H3K9)发生甲基化,基因表达为此而受到抑制,即siRNA能在转录水平调控基因的表达(transcriptionalgenesilence,TGS).同时,siRNA在异染色质的形成中也起着重要的作用,RNAi突变会激活原异染色质区域中沉默基因的表达。