生物信息学预测与实验验证相结合策略筛选鉴定新的人分泌蛋白基因

中国生物工程杂志

2004, Vol. 24

Issue (12): 1-5

论文

生物信息学预测与实验验证相结合策略筛选鉴定新的人分泌蛋白基因

周宇波^1,2, 刘锋², 朱智东², 朱弘², 张新², 王志勤², 刘建华¹, 韩泽广²

1. 上海交通大学生命科学技术学院, 上海 200030;
2. 国家人类基因组南方研究中心, 上海, 201203

^1,2

全文: PDF(229 KB) HTML

摘要：

使用生物信息学预测结合实验验证的策略筛选鉴定人新的分泌蛋白基因。用SignalP、SOSUI、PSORT和BLAST等程序对UniProt蛋白数据库进行生物信息学分析 ,筛选出用于实验验证的 1 4个功能未知基因。采用RT PCR方法 ,克隆得到 1 4个基因的全长编码序列 ,并构建到真核表达载体pcDNA3.1 ( - ) Myc His质粒。采用蛋白质印迹与免疫荧光分析 ,检测到其中 7个基因的表达。除其中一个在细胞核表达外 ,其余 6个只在细胞质中表达 ;其中的 4个基因的表达产物在细胞培养液中可被检测到 ,鉴定为 4个新的分泌蛋白基因。

关键词： 生物信息学; 分泌蛋白; 逆转录-聚合酶链式反应; 蛋白质印迹; 免疫荧光

收稿日期: 2004-08-03 出版日期: 2004-12-25

基金资助:

国家“863”计划资助项目(2002BA711A01-02)

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引用本文:

周宇波, 刘锋, 朱智东, 朱弘, 张新, 王志勤, 刘建华, 韩泽广. 生物信息学预测与实验验证相结合策略筛选鉴定新的人分泌蛋白基因[J]. 中国生物工程杂志, 2004, 24(12): 1-5.

链接本文:

https://manu60.magtech.com.cn/biotech/CN/Y2004/V24/I12/1

[1]	倪璇, 高金欣, 余传金, 刘铜, 李雅乾, 陈捷. *玉米弯孢叶斑病菌clt-1基因生物信息学分析和启动子的功能鉴定*[J]. 中国生物工程杂志, 2017, 37(3): 37-42.
[2]	闫鹏程, 张占江, 裴智勇, 付延婷, 陈禹保, 刘彤. 药用植物保育云服务平台设计与实现[J]. 中国生物工程杂志, 2017, 37(11): 37-44.
[3]	刘雁霞, 樊振川. 莱茵衣藻LZTFL1蛋白的多克隆抗体制备及应用[J]. 中国生物工程杂志, 2017, 37(11): 109-115.
[4]	张丽丽, 徐碧玉, 刘菊华, 贾彩红, 张建斌, 金志强. *转香蕉MaASR1基因的拟南芥株系在干旱胁迫条件下的表达谱分析*[J]. 中国生物工程杂志, 2017, 37(11): 59-73.
[5]	何石宝, 杨成飞, 尚杉, 王凌燕, 唐文超, 朱勇. *家蚕保幼激素结合蛋白Bmtol基因的克隆及表达分析*[J]. 中国生物工程杂志, 2017, 37(10): 16-25.
[6]	陈利娜, 滕牧洲, 卢严方, 郑文岭, 马文丽. miR-335在肿瘤组织中的表达及其预测靶基因的生物信息学分析[J]. 中国生物工程杂志, 2016, 36(3): 23-30.
[7]	谢春芳, 黎玉凤, 刘大岭, 姚冬生. 利用N-糖基化修饰对β-甘露聚糖酶Man47的稳定性改造[J]. 中国生物工程杂志, 2013, 33(12): 79-85.
[8]	申健, 张越, 潘秋辉, 孙奋勇. 生物信息学分析及预测miR-17-92的分子调控网络[J]. 中国生物工程杂志, 2012, 32(03): 69-75.
[9]	李浩, 殷瑛, 毛亚丽, 董大勇, 张军, 付玲, 郭继红, 徐俊杰, 陈薇. 结核分枝杆菌ESAT-6蛋白的重组表达及膜定位研究[J]. 中国生物工程杂志, 2011, 31(5): 55-59.
[10]	李浩殷瑛毛亚丽董大勇张军付玲郭继红徐俊杰陈薇. 结核分枝杆菌ESAT-6蛋白的重组表达及膜定位研究[J]. 中国生物工程杂志, 2011, 31(05): 0-0.
[11]	E Guang-xin, LIU Di, ZHANG Dong-jie, CUI Yu. *猪精氨酸-丝氨酸蛋白激酸3(SRPK3)基因的克隆、表达及多态性分析*[J]. 中国生物工程杂志, 2011, 31(03): 46-54.
[12]	邓孟垚, 曹亚. 血清分泌蛋白质组学在肿瘤中的研究进展[J]. 中国生物工程杂志, 2010, 30(11): 83-87.
[13]	胡明明朱运峰王越王宇张亮高旭东董金凯于继云. LINE-1编码蛋白L1-ORF1的原核表达纯化和多克隆抗体制备[J]. 中国生物工程杂志, 2010, 30(10): 0-0.
[14]	胡明明, 朱运峰, 王越, 王宇, 张亮, 高旭东, 董金凯, 于继云. LINE-1编码蛋白L1-ORF1的原核表达纯化和多克隆抗体制备[J]. 中国生物工程杂志, 2010, 30(10): 7-11.
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