药用植物保育云服务平台设计与实现

doi:10.13523/j.cb.20171106

中国生物工程杂志

2017, Vol. 37

Issue (11): 37-44 DOI: 10.13523/j.cb.20171106

计算生物学与生物信息学专栏

药用植物保育云服务平台设计与实现

闫鹏程¹, 张占江², 裴智勇¹, 付延婷¹, 陈禹保¹, 刘彤¹

1. 北京市计算中心生物计算事业部云计算关键技术与应用北京市重点实验室北京 100094;
2. 广西壮族自治区药用植物园南宁 530023

Design and Realization of Cloud Platform for Medicinal Plant Conservation

YAN Peng-cheng¹, ZHANGY Zhan-jiang², PEI Zhi-yong¹, FU Yan-ting¹, CHEN Yu-bao¹, LIU Tong¹

1. Department of Computational Biology in Beijing Computing Center, Beijing Key Laboratory of Cloud Computing Key Technology and Application, Beijing 100094, China;
2. Guangxi Zhuang Autonomous Region Medicinal Botanical Garden, Nanning 530023, China

全文: PDF(2085 KB) HTML

摘要： 药用植物资源是中医药事业和生物医药产业赖以生存和发展的重要资源，同时也是我国的中医药文化遗产的载体。而药用植物资源的保育工作是药植资源可持续性开发与应用的基础。随着生物信息学与信息化技术的快速发展，利用包括云计算在内的新兴信息化技术，在传统种质资源保护与管理等方面的应用越来越多，然而，在药用植物资源保育方面还有待开发与应用。利用云计算、数据库应用及生物信息学等相关技术，对我国药用植物资源的保育数据进行信息化及平台建设，构建药用植物保育云服务平台系统。该系统通过收集、整理和加工药用植物资源信息，开展药用植物数据信息化与应用开发，完成药用植物保育云服务平台，可提供药用植物保护及新物种培育等方面信息查询服务。该平台对于药用植物研究相关的数据标准化、保育学科研究，以及信息共享与服务，具有较为重要的应用价值与社会意义。

关键词： 药用植物; 保育; 生物信息学; 云平台; Web应用

Abstract: Medicinal plants are important resources for the development of traditional Chinese medicine and biomedical industry. They are also the carrier of traditional Chinese medicine cultural heritage. The conservation of medicinal plants is the basis of their sustainable development and application. With the rapid development of bioinformatics and information technology, there are more and more applications of them, including cloud computing, in the protection and management of traditional germplasm resources. However, their applications in the conservation of medicinal plant resources remain to be developed. A cloud platform system for medicinal plant conservation in China is constructed. In this system, cloud computing, database applications, bioinformatics and other related technologies were used. By collecting, sorting and processing the information of medicinal plant resources, carrying out the information and application development, this system could provide information inquiry service for medicinal plant protection and cultivation of new species. This platform has important application value and social significance for the standardization of data related to medicinal plant research, conservation subject research, and information sharing and service.

Key words: Conservation Medicinal plant Cloud platform Web application Bioinformatics

收稿日期: 2017-06-02 出版日期: 2017-11-15

ZTFLH:

Q811.4

基金资助: 北京市财政资助项目（PXM2016_178102_000004）

通讯作者: 陈禹保, 刘彤 E-mail: liutong@bcc.ac.cn;Chenyb@bcc.ac.cn

	服务
	把本文推荐给朋友
	加入引用管理器
	E-mail Alert
	RSS
	作者相关文章
	付延婷
	张占江
	刘彤
	闫鹏程
	裴智勇
	陈禹保

引用本文:

闫鹏程, 张占江, 裴智勇, 付延婷, 陈禹保, 刘彤. 药用植物保育云服务平台设计与实现[J]. 中国生物工程杂志, 2017, 37(11): 37-44.

YAN Peng-cheng, ZHANGY Zhan-jiang, PEI Zhi-yong, FU Yan-ting, CHEN Yu-bao, LIU Tong. Design and Realization of Cloud Platform for Medicinal Plant Conservation. China Biotechnology, 2017, 37(11): 37-44.

链接本文:

https://manu60.magtech.com.cn/biotech/CN/10.13523/j.cb.20171106 或 https://manu60.magtech.com.cn/biotech/CN/Y2017/V37/I11/37

[1]	张惠源, 袁昌齐, 孙传奇,等. 我国的中药资源种类. 中国中药杂志, 1995, 20(7):387-390. Zhang H Y, Yuan C Q, Sun C Q, et al. Resources of Chinese materia medica in China. China Journal of Chinese Materia Medica, 1995. 20(7):387-390.
[2]	丁建,夏燕莉. 中国药用植物资源现状. 资源开发与市场, 2005, 21(5):453-454. Ding J, Xia Y L. Present situation of chiness medicinal plant resources. Resource Development & Market, 2005, 21(5):453-454.
[3]	萧伟, 陈凤龙, 章晨峰, 等. 国内外天然药物研究的发展现状和趋势. 中草药, 2009, 40(11):1681-1687. Xiao W, Chen F L, Zang C F, et al. Actuality and new trend on research of natural medicines in China and overseas, Chiness Traditional And Herbal Drugs, 2009,40(11):1681-1687.
[4]	徐妍,臧绍刚. 野生植物资源信息检索数据库的建立和使用. 山地农业生物学报, 2000, 19(6):457-459. Xu Y, Zang S G. Establishment and application of information retrieval database of wild plant resources. Journal of Mountain Agriculture and Biology, 2000,19(6):457-459.
[5]	徐宏发,蒋志刚. 中国药用动植物资源保护和可持续利用. 上海:华东师范大学出版社, 2003. Xu H F, Jiang Z G. Conservation and Sustainable Utilization of Medicinal Plant Resources in China. Shanghai:East China Normal University Press, 2003.
[6]	Ladd S, Davison D, Devijver S, 等. 深入解析Spring MVC与Web Flow.徐哲,沈艳,译. 北京:人民邮电出版社, 2008. Ladd S, Davison D, Devijver S, et al. Expert Spring MVC and Web Flow. Xu Z, Shen Y. Beijing:Posts & Telecom Press,2008.
[7]	夏昕, 曹晓钢,唐勇. 深入浅出Hibernate. 北京:电子工业出版社, 2005. Xia X, Cao X G, Tang Y, Head First Hibernate. Beijing:Publishing House of Electronics Industry, 2005.

[1]	倪璇, 高金欣, 余传金, 刘铜, 李雅乾, 陈捷. *玉米弯孢叶斑病菌clt-1基因生物信息学分析和启动子的功能鉴定*[J]. 中国生物工程杂志, 2017, 37(3): 37-42.
[2]	张丽丽, 徐碧玉, 刘菊华, 贾彩红, 张建斌, 金志强. *转香蕉MaASR1基因的拟南芥株系在干旱胁迫条件下的表达谱分析*[J]. 中国生物工程杂志, 2017, 37(11): 59-73.
[3]	何石宝, 杨成飞, 尚杉, 王凌燕, 唐文超, 朱勇. *家蚕保幼激素结合蛋白Bmtol基因的克隆及表达分析*[J]. 中国生物工程杂志, 2017, 37(10): 16-25.
[4]	陈利娜, 滕牧洲, 卢严方, 郑文岭, 马文丽. miR-335在肿瘤组织中的表达及其预测靶基因的生物信息学分析[J]. 中国生物工程杂志, 2016, 36(3): 23-30.
[5]	李东巧, 郭文姣, 陈芳. 基于专利分析的转基因药用植物技术发展趋势研究[J]. 中国生物工程杂志, 2016, 36(11): 98-108.
[6]	冯亚斌, 庄欣晨, 沈晓霞, 江建铭, 王忠华. 药用植物甾体生物碱的药理作用及合成途径[J]. 中国生物工程杂志, 2016, 36(1): 101-107.
[7]	谢春芳, 黎玉凤, 刘大岭, 姚冬生. 利用N-糖基化修饰对β-甘露聚糖酶Man47的稳定性改造[J]. 中国生物工程杂志, 2013, 33(12): 79-85.
[8]	申健, 张越, 潘秋辉, 孙奋勇. 生物信息学分析及预测miR-17-92的分子调控网络[J]. 中国生物工程杂志, 2012, 32(03): 69-75.
[9]	E Guang-xin, LIU Di, ZHANG Dong-jie, CUI Yu. *猪精氨酸-丝氨酸蛋白激酸3(SRPK3)基因的克隆、表达及多态性分析*[J]. 中国生物工程杂志, 2011, 31(03): 46-54.
[10]	黄俊丽刘太波王贵学李贤勇. 水稻高叶绿素含量基因DET1 cDNA的克隆、生物信息学分析及超表达载体的构建[J]. 中国生物工程杂志, 2010, 30(04): 60-64.
[11]	廖冰,吴宁,韩凤桐,林秀坤. 牛性别决定新基因Fgf9的克隆及生物信息学分析[J]. 中国生物工程杂志, 2009, 29(08): 45-50.
[12]	易乐飞,王萍,周向红,刘楚吾. 条斑紫菜SAMS基因克隆与生物信息学分析[J]. 中国生物工程杂志, 2009, 29(07): 43-49.
[13]	张雨良,张智俊,杨峰山,Mahesh Kulye,袁辉,罗淑萍. 新疆盐生植物车前PmNHX1基因的克隆及生物信息学分析[J]. 中国生物工程杂志, 2009, 29(01): 27-33.
[14]	孔路科,郭建巍,马骢,杨林西,魏杰,吴素香. 质粒介导的AmpC β-内酰胺酶共有抗原表位的预测及原核表达[J]. 中国生物工程杂志, 2008, 28(9): 32-38.
[15]	李建霞,苗向阳,任慧英,于忠娜. 抗口蹄疫病毒相关基因的筛选及分析[J]. 中国生物工程杂志, 2008, 28(7): 48-52.

Viewed

Full text

Abstract

Cited

Shared

Discussed