Please wait a minute...

中国生物工程杂志

CHINA BIOTECHNOLOGY
中国生物工程杂志  2008, Vol. 28 Issue (2): 96-100    
论文     
侵染落葵的黄瓜花叶病毒分离物CP基因序列分析
牛立霞 牛胜鸟 王健华 刘志昕
中国热带农业科学院热带生物技术研究所 中国热带农业科学院海口实验站 热带生物技术研究所
Sequence Analysis of Coat Protein Gene of Cucumber Mosaic Virus Isolate Infecting Basella rubra L.
 全文: PDF(8168 KB)   HTML
摘要:

通过间接酶联免疫法(ID-ELISA)检测到染病落葵病样中存在黄瓜花叶病毒(Cucumber Mosaic Virus,CMV)。从病叶中提取总RNA,用RT-PCR方法扩增得到657bp的CMV CP基因片断,将扩增产物与T载体连接并进行测序。用DNA MAN将得到的CP基因序列与GenBank收录的黄瓜花叶病毒两亚组部分株系或分离物的CP基因序列进行比较,结果表明该CP基因与CMV亚组Ⅰ、亚组Ⅱ之间的核苷酸序列同源性分别为91.17~95.43%和75.30~75.76%,推导氨基酸序列同源性分别为95.41~97.71%和81.28~81.74%,表明CMV-Ba与亚组Ⅰ同源关系密切。

关键词: 落葵黄瓜花叶病毒CP基因序列分析    
Abstract:

Cucumber mosaic virus was detected from infected Basella rubra L. with the indirect enzyme-linked immunosorbent assay. Total RNA was extracted from infected leaves and the cDNAs of coat protein gene of CMV-Ba were obtained by RT-PCR. The amplified cDNA fragments were then cloned into pMD 18-T vector and sequenced,the result showed that the CP gene was 657 nucleotides in length. This sequence was aligned with the obtained CP gene and some CMV strains or isolates of subgroup Ⅰ and subgroup Ⅱ in GenBank using DNA MAN software. The results showed that CMV-Ba shared 90.9% -93.8% and 76.1%-76.9% identity with the known CP genes of subgroup Ⅰ and Ⅱ respectively in nucleotide level,on the other hand,amino acids deduced from CMV-Ba CP gene shared 92.7% -97.7% and 72.4%-78.1% identity with the known CP protein of subgroup Ⅰ and Ⅱ,respectively. This suggested that CMV-Ba CP gene belongs to CMV subgroupⅠ.

Key words: Basella rubra L.    Cucumber mosaic virus    coat protein gene    Sequence analysis
收稿日期: 2007-10-12 出版日期: 2008-02-25
通讯作者: 刘志昕   
服务  
把本文推荐给朋友
加入引用管理器
E-mail Alert
RSS
作者相关文章  
牛胜鸟
刘志昕
王健华
牛立霞

引用本文:

牛立霞,牛胜鸟,王健华,刘志昕. 侵染落葵的黄瓜花叶病毒分离物CP基因序列分析[J]. 中国生物工程杂志, 2008, 28(2): 96-100.

. Sequence Analysis of Coat Protein Gene of Cucumber Mosaic Virus Isolate Infecting Basella rubra L.. China Biotechnology, 2008, 28(2): 96-100.

链接本文:

https://manu60.magtech.com.cn/biotech/CN/        https://manu60.magtech.com.cn/biotech/CN/Y2008/V28/I2/96

[1] 张巧珍,吴雯婷,李紫萱,赵心博,胡兵,刘聪,隋正伟,刘宏图,章乐. 采用数据挖掘技术对湖北省人类狂犬病开展生物信息学研究 *[J]. 中国生物工程杂志, 2021, 41(2/3): 14-29.
[2] 明玥,赵自通,王鸿磊,梁志宏. 基于序列和结构分析的酶热稳定性改造策略*[J]. 中国生物工程杂志, 2021, 41(10): 100-108.
[3] 张艳芳, 孙瑞芬, 郭树春, 侯建华. 向日葵V-ATPase a3亚基基因的克隆及表达分析[J]. 中国生物工程杂志, 2017, 37(5): 19-27.
[4] 李高, 杨杞, 张烨, 王颖, 张涛, 李国婧, 王瑞刚. 柠条锦鸡儿肉桂酰辅酶A还原酶基因克隆和分析[J]. 中国生物工程杂志, 2014, 34(1): 50-56.
[5] 李建波, 江明锋, 王永. 藏绵羊乳腺溶菌酶基因的克隆、原核表达及抗菌活性研究[J]. 中国生物工程杂志, 2013, 33(8): 38-44.
[6] 张乐, 陈宣钦, 王琳, 陈丽梅, 李昆志. 丹波黑大豆醛脱氢酶基因GmALDH3-1 的克隆、原核表达和功能分析[J]. 中国生物工程杂志, 2013, 33(5): 86-92.
[7] 李高, 杨杞, 张烨, 王瑞刚, 李国婧. 柠条锦鸡儿香豆酸-3-羟化酶基因克隆及其功能初步研究[J]. 中国生物工程杂志, 2013, 33(4): 61-67.
[8] 王盛, 曹慜, 董洁, 穆红珍, 丁国平, 张虹. 黄瓜花叶病毒2b蛋白C末端无抑制局部RNA沉默的活性[J]. 中国生物工程杂志, 2013, 33(1): 20-26.
[9] 朱镭,张政希,倪国新,徐学敏,林标扬,李伟. 重组C8orf32蛋白的表达、纯化及抗体制备[J]. 中国生物工程杂志, 2009, 29(04): 1-5.
[10] 马赛箭,苏乔,吴凇,安利佳. 盐角草磷酸乙醇胺N-甲基转移酶基因(SePEAMT)启动子的克隆及瞬时表达[J]. 中国生物工程杂志, 2008, 28(8): 69-73.
[11] 孟鑫,阚国仕,刘剑利,王晓丹,陈红漫. 一株耐碱Mn-SOD高产细菌的分离、基因克隆及序列分析[J]. 中国生物工程杂志, 2007, 27(5): 101-106.
[12] 费春红,吴建平,杨联,张利平,王佳. 牦牛CAPN1基因的克隆与序列分析[J]. 中国生物工程杂志, 2007, 27(12): 90-94.
[13] 石生林 潘敏慧 鲁成. 柞蚕核型多角体病毒PstⅠ-B、C片断克隆及序列分析[J]. 中国生物工程杂志, 2007, 27(1): 85-85.
[14] 王伟利,周宇,赵丽,刘明,钱爱东. 鸽源H5N1亚型禽流感病毒株的HA和NA基因特征性分析[J]. 中国生物工程杂志, 2006, 26(05): 17-21.
[15] ,刘志华,杨谦,杨力明. 球毛壳菌(Chaetomium globosum)过氧化物膜蛋白过敏原基因克隆、序列分析及原核表达[J]. 中国生物工程杂志, 2006, 26(04): 40-45.